Nie mniejszy wpływ na skórę od czynników zewnętrznych, mają czynniki wewnętrzne. Przyczyną wielu chorób skóry i niektórych jej niedomagań, są zaburzenia ogólnoustrojowe i choroby narządów wewnętrznych.
Skóra człowieka jest jak gdyby fotografią organizmu. Zaburzenia przewodu pokarmowego objawiają się swędzeniem skóry, pokrzywką i pogłębiają stany łojotokowe, trądzika pospolitego czy różowatego. Cukrzyca tkanek powoduje ich odwodnienie, sprzyja zakażeniem ropnym, np. zapaleniu torebek włosowych oraz czyraczności, powoduje swędzenie skóry, uczula skórę na bodźce świetlne.
Uszkodzenie wątroby, która jak wiadomo niszczy jady bakteryjne i wiąże ciała trujące, może być przyczyną wysypek polekowych. Osutki polekowe występują często po doustnym podaniu leku. Nadmierne wydzielanie potu może występować pod wpływem różnych chorób (nadczynności tarczycy, gruźlicy), jak również czynników psychicznych. Niektóre schorzenia narządów wewnętrznych przez zapach potu sygnalizują o rozwoju choroby, np. przy upośledzonym funkcjonowaniu nerek pot może mieć zapach moczu, co świadczy o współpracy między nerkami a skórą. Podobnie spożycie pewnych pokarmów, jak np. czosnku, powoduje cuchnący zapach potu.
Koloryt skóry sygnalizuje niejednokrotnie o takich chorobach, jak niewydolność krążenia (objawiająca się sinicą skóry). Przebarwienia w postaci plam występują również przy niektórych stanach fizjologicznych, np. ciąża. Zmiany barwnikowe na skórze występują często przy zaburzeniach czynnościowych gruczołów wewnętrznych, wydzielania gruczołów płciowych, przysadki itp. W okresie miesiączki, kiedy jest zmniejszona odporność organizmu, występują różnego rodzaju wykwity: opryszczka, zaostrzenie objawów trądziku pospolitego, różowatego, zwiększone wydzielanie potu. Pospolity katar łączy się wypryskami w okolicy nosa i skóry twarzy. Wyrazem zaburzeń naczynioruchowych jest np. trądzik różowaty, pokrzywka.
Wielki wpływ na wygląd skóry i jej odczynowość ma również układ hormonalny. Łojotok wiąże się z działaniem gruczołów płciowych, tarczycy. Wadliwe rogowacenie naskórka wiąże się z zaburzeniami tarczycy i gruczołów przytarcznych. Wypadanie włosów - z zaburzeniami gruczołów płciowych, przysadki, tarczycy, nadnerczy, nadmierne owłosienie - z gruczołami płciowymi, nadnerczem.